Innhold

• Hovedforskjell
• Type I Restriksjonsenzymer
• Type II restriksjonsenzymer
• Viktige forskjeller

Hovedforskjell

Hovedforskjellen mellom type I og type II restriksjonsenzymer er, type I restriksjonsenzymer er svært kompliserte sammenlignet med type II restriksjonsenzymer, og bortsett fra det består type I restriksjonsenzymer av tre ikke identiske underenheter. Mens derimot består type II-restriksjonsenzymer av to identiske underenheter. Nukleaser som kuttes i DNA i en intern stilling er kjent som restriksjonsenzym. Poenget der disse restriksjonsenzymene kutter midt i DNA, men ikke på slutten. For denne egenskapen av restriksjonsenzymer er de kjent som endonukleaser. Disse restriksjonene kalles også molekylsaks, molekylære kniver, molekylære skalpeller eller restriksjonsenzymer. Anerkjennelsessted eller restriksjonssted er regionen der disse restriksjonsenzymene kutter DNA. Dette restriksjonssete har minst 4-8 basepar. Det er tre grupper av disse restriksjonsenzymene, som er som følger:

• Type I-begrensning endonuklease
• Type II restriksjon endonuklease
• Type III restriksjon endonuklease

Type I Restriksjonsenzymer

Type I-enzymer er multi-subenheter og er en kompleks kombinasjon av modifikasjons- og restriksjonsenzymer. Disse enzymene kutter DNA på tilfeldige punkter, men langt fra deres gjenkjennelsessekvenser. Disse enzymer var kjent for å være veldig sjeldne, men nå etter analyse av sekvenserte genomer har vi funnet ut at de er vanlige. Type I-restriksjonsenzymer lager ikke gelbindingsmønster eller diskrete restriksjonsfragmenter, derfor brukes de praktisk talt ikke så mye som type II-enzymer, men de har særlig biokjemisk betydning.

Type II restriksjonsenzymer

Type II-restriksjonsenzymer på sitt gjenkjennelsessted eller i nærheten av deres gjenkjennelsessteder, på definerte posisjoner Bortsett fra det produserer de diskrete gelbindingsmønstre og diskrete fragmenter. De har mye praktisk verdi og brukes veldig ofte. De er allment tilgjengelig kommersielt. De fleste av disse enzymene binder seg til DNA som homodimerer, og de gjenkjenner også DNA-sekvenser som er symmetriske. Noen av disse restriksjonsenzymene gjenkjenner også asymmetriske DNA-sekvenser fordi de binder seg som heterodimerer. Noen enzymer gjenkjenner også sekvenser som er kontinuerlige. I tesesekvensene ligger to halve steder ved siden av gjenkjennelsessekvensen. Noen av disse enzymene gjenkjenner også sekvenser som er diskontinuerlige, hvor halve steder er separert fra hverandre. Spaltningen som oppstår i DNA etterlater 5 fosfat på den ene siden og 3 hydroksyl på den andre siden. De er mindre med underenheter som ligger i området rundt 200-350. De vanligste type II-enzymer er type IIS. De klistrer seg utenfor gjenkjennelsessiden til den ene siden. De er normale i størrelse, og de gjenkjenner sekvenser som er asymmetriske og kontinuerlige. De har to domener, ett for DNA og det andre for spaltning av DNA. For de fleste deler binder de DNA som monomerer. DNA-tråder som inneholder forskjellige gjenkjennelsessteder, type II-anerkjennelsesenzymer er veldig aktive på dem. En annen type type II-enzymer er type IIG. De har restriksjons- og modifikasjonsenzymer, dessuten er de store.

Viktige forskjeller

1. Type I-restriksjonsenzymer er mer komplekse sammenlignet med type II-restriksjonsenzymer.
2. Type I-anerkjennelsesenzymer består av tre ikke identiske underenheter. Type II-gjenkjennelsesenzymer består av to identiske underenheter.
3. Molekylvekt av type I-restriksjonsenzymer er 400000 dalton. Molekylvekt av type II-restriksjonsenzymer er 20.000 til 100.000 dalton.
4. Stedet for kutting av type I-restriksjonsenzymer er 1000 nukleotider borte fra gjenkjennelsesstedet. Stedet for kutting av type II-restriksjonsenzymer er på det samme gjenkjennelsesstedet.
5. Sekvensen av skjæring er ikke spesifikk for type I-restriksjonsenzymer. Sekvens av skjæring er spesifikk i type II-restriksjonsenzymer.
6. Type I-enzymer er ansvarlige for å beskytte DNA ved metylering og type II-enzymer har ingen metyleringsaktivitet.
7. For aktivering av type I-enzymer er ATP, Mg2 + og adenosylmetionin nødvendig. For aktivering av type II-enzymer er det bare Mg2 + som kreves.
8. Type I-enzym har endonuklease og metylase-aktivitet, begge. Type II har bare restriksjonsaktivitet, den har ikke endonuklease eller metylase-aktivitet.
9. Type I-enzymer ble identifisert før type II-enzymer.
10. Type I ble identifisert i to forskjellige stammer av E.Coli.
11. Eksempler på type I-enzymer er, Ecok og EcoB. Eksempler på type II-enzymer er Hind II og EcoRI.