Innhold
- Hovedforskjell
- Sørblotting vs. Western Blotting
- Sammenligningstabell
- Hva er Southern Blotting?
- Hva er Western Blotting?
- Viktige forskjeller
- Konklusjon
Hovedforskjell
Hovedforskjellen mellom Southern Blotting og Western Blotting er at Southern Blotting er en teknikk som brukes til å påvise et spesifikt DNA-fragment i en gitt prøve, mens Western Blotting brukes til å finne ut et spesifikt protein i en gitt prøve.
Sørblotting vs. Western Blotting
Blotting er en teknikk som brukes av forskere for å skille forskjellige typer molekyler fra en blanding eller prøve. I denne teknikken beveger makromolekyler som nukleinsyrer (DNA og RNA) og proteiner i en blanding seg gjennom en plate med gel. Her vil minuttpartikler bevege seg raskere enn de større. Disse molekylene presses mot overflaten av en immobilisert membran som overfører molekylene til membranen. Det er forskjellige typer blotting på grunnlag av deteksjon av spesifikt materiale, dvs. sørlig blotting, nordlig blotting og western blotting. Southern blotting er den type blotting som brukes til å oppdage DNA mens western blotting brukes til å finne ut protein. Southern blotting ble utviklet av Edward M. Southern i 1975. Så det er kjent som Southern blotting. På den annen side ble western blotting utviklet av George Starks gruppe ved Stanford University i 1979. Dette navnet ble brukt til å matche den sørlige blotting. Southern blotting brukes til å finne ut en spesifikk DNA-sekvens, mens western blotting brukes til å finne ut en spesifikk aminosyre eller proteinsekvens.
Sammenligningstabell
Sørblotting | Western Blotting |
En teknikk som brukes for å finne ut en spesifikk DNA-sekvens i en gitt blanding er kjent som sørlige blotting. | En teknikk som brukes for å finne ut en spesifikk aminosyresekvens av proteinet i en gitt blanding er kjent som sørlige blotting. |
Utviklet av | |
Southern blotting ble utviklet av Edward M. Southern i 1975. | Western blotting ble utviklet av George Starks gruppe ved Stanford University i 1979. |
Type påvisning | |
Southern blotting brukes til å finne ut en spesifikk DNA-sekvens. | Western blotting brukes til å finne ut en spesifikk aminosyre eller proteinsekvens. |
Prinsipp | |
Det fungerer på prinsippet om hybridisering. | Det fungerer etter prinsippet om immunodeteksjonsmetode eller antigen-antistoff-interaksjon. |
Sonde | |
Et enkeltstrenget DNA eller noen ganger RNA brukes som sonde. | Primære og sekundære antistoffer brukes som en sonde. |
Gelelektroforese | |
Agarosegelelektroforese brukes i sørlig blotting. | SDS PAGE / Polyacrylamide gel brukt til å skille proteiner i western blotting |
Blotting Prosedyre | |
Southern blotting følger prosedyren for kapillæroverføring. | Western Blotting følger prosedyre for elektrisk overføring. |
Prøve | |
Under den sørlige blotting må prøven denatureres. | Under vestlig blotting bør prøven være i sin opprinnelige tilstand. |
blokkering | |
Ingen trinn som blokkering er involvert i sørlig blotting. | Under vestlig blotting blokkeres ikke-spesifikke antistoffsteder på nitrocellulosepapiret ved hjelp av melkepulver eller bovint serumalbumin (BSA). |
Merkingsmetoder | |
Vanlige merkingsmetoder som brukes i sørlig blotting er bruk av kromogene fargestoffer eller radiomerking eller fluorescerende merking etc. | Merkingsmetoder som brukes i western blotting, er bruk av fluorescerende merket antistoff eller radiomerking, kromogene fargestoffer eller dannelse av diaminobenzidin, etc. |
Deteksjonsmetoder | |
Deteksjon av lys, Autoradiograf og fargeendringer brukes som deteksjonsmetoder i sørlig blotting. | Deteksjonsmetoder i western blotting er endringer i farge og påvisning av lys etc. |
applikasjon | |
Southern blotting brukes i DNA-påvisning, farskapstesting, DNA-fingring, for identifisering av offer, for å identifisere kriminelle, for å finne smittestoffer og for å identifisere mutasjon eller genarrangement, etc. | Western blotting brukes til å finne antall proteiner i en blanding, for å oppdage tilstedeværelse av HIV, virus og bakterier, etc. i serumet, for å finne ut defekte proteiner og brukes som et bestemt mål for herpes, hepatitt B, Lyme sykdom, og Creutzfeldt-Jacob sykdom, etc. |
Hva er Southern Blotting?
Southern blotting er den eldste blotting metoden som ble gitt av Edwin Southern således, kalt South blot. Det brukes til å finne ut en spesifikk sekvens av DNA i en gitt prøve eller blanding. Trinn involverer under sørlig blotting er elektroforese, overføring og deteksjon av spesifikke sekvenser. Først av alt blir DNA fragmentert ved hjelp av spesifikt restriksjonsenzym. Deretter blir ønskede DNA-fragmenter separert gjennom gelelektroforese. Disse fragmentene blir denaturert ved hjelp av en alkalisk løsning, for eksempel NaOH, etc. for å skille de to DNA-strengene. Disse enkeltstrengede DNA-fragmentene ble deretter overført på en membran gjennom prosessen med blotting. Dette membranbundne DNA blir deretter behandlet med en merket sonde. Denne sonden vil feste seg til sin komplementære streng på membran-DNA som kan visualiseres ved autoradiogram etc.
Hva er Western Blotting?
Western blotting-metoden ble oppfunnet av George Starks gruppe ved Stanford University som brukes til å identifisere en spesifikk sekvens av aminosyrer i proteinet. Det er også kjent som protein blot eller immunblotting. Trinnene under western blotting er elektroforese, overføring og påvisning av spesifikke proteiner. Først av alt, homogeniser blandingen. Deretter skilles molekylet av interesse ved hjelp av elektroforese. Overfør disse molekylene på membranen og identifiser det spesifikke proteinet ved å bruke spesifikk sonde.
Viktige forskjeller
- En teknikk som brukes for å finne ut en spesifikk DNA-sekvens i en gitt blanding er kjent som sørlige blotting, mens en teknikk som brukes for å finne ut en spesifikk aminosyresekvens av proteinet i en gitt blanding er kjent som sørlig blotting.
- Southern blotting ble utviklet av Edward M. Southern i 1975, kjent som sørlige blotting. På den annen side ble western blotting utviklet av George Starks gruppe ved Stanford University i 1979.
- Southern blotting brukes til å finne ut en spesifikk DNA-sekvens. Motsatt brukes western blotting for å finne ut en spesifikk aminosyre eller proteinsekvens.
- Southern blotting fungerer etter prinsippet om hybridisering på baksiden. western blotting fungerer etter prinsippet om immunodeteksjonsmetode eller antigen-antistoff-interaksjon.
- Et enkeltstrenget DNA eller noen ganger RNA brukes som en sonde i sørlig blotting på den andre siden, i vestlig blotting brukes primære og sekundære antistoffer som en sonde.
- Agarosegelelektroforese brukes i sørlig blotting mens SDS PAGE / Polyacrylamide gel brukes til å skille proteiner i western blotting.
- Southern blotting følger prosedyre for kapillæroverføring, derimot; western Blotting følger prosedyre for elektrisk overføring.
- Under sørlig blotting må prøven denatureres, mens prøven under den vestlige blotting bør være i sin opprinnelige tilstand.
- Ingen trinn som blokkering er involvert i sørlig blotting på baksiden, mens vestlig blotting blokkeres ikke-spesifikke antistoffsteder på nitrocellulosepapiret ved hjelp av melkepulver eller bovint serumalbumin (BSA).
- Vanlige merkingsmetoder som brukes i sørlig blotting er bruk av kromogene fargestoffer eller radiomerking eller fluorescerende merking osv. Mens merkingsmetoder som brukes i vestlig blotting er bruk av fluorescerende merket antistoff eller radiomerking, kromogene fargestoffer eller dannelse av diaminobenzidin, etc.
- Deteksjon av lys, Autoradiograf og fargeendringer brukes som deteksjonsmetoder i sørlig blotting, mens deteksjonsmetoder i vestlig blotting er endringer i farge og påvisning av lys, etc.
- Southern blotting brukes i DNA-deteksjon, farskapstesting, DNA-fingring, for identifisering av offer, for å identifisere kriminelle, for å finne smittestoffer og for å identifisere mutasjon eller genarrangement, osv. Omvendt brukes western blotting for å finne antall proteiner i en blanding, for å oppdage tilstedeværelse av HIV, virus og bakterier, etc. i serumet, for å finne ut defekte proteiner og brukes som et bestemt mål for herpes, hepatitt B, Lyme sykdom og Creutzfeldt-Jacob sykdom, etc.
Konklusjon
Over diskusjonen oppsummerer at sørlig blotting er den eldste blotting teknikken som ble brukt for å finne ut spesifikt DNA-segment i en prøve mens western blotting ble oppdaget sistnevnte og ble brukt til å identifisere en spesifikk sekvens av aminosyrer eller et spesifikt protein.